Финансово-экономическое Управление считается одной из основных Управлений Комитета, Финансово-экономическое Управление осуществляет, управляет финансовым расходом государственного товара и вещевым довольствием в Комитете. Со дня образования Комитета по чрезвычайным ситуациям и делам гражданской обороны при Правительстве Республики Таджикистана был образован финансово –ревизионный отдел, в 1997 году был переименован в финансово-ревизионное Управление, а с 1999 года был переименован в Финансово-экономическое Управление.
После преобразования, Финансово-экономическое Управление состоит из следующих отделов и секторов:
Отдел центральной бухгалтерии
Административно хозяйственный отдел
Пенсионный сектор
Плановый сектор
Отдел центральной бухгалтерии
Административно хозяйственный отдел
Пенсионный сектор
Плановой сектор