Главное управление гражданской обороны Решением Правительства Республики Таджикистан «О Комитете по чрезвычайным ситуациям и гражданской обороне при Правительстве Республики Таджикистан» от 29 ноября 2018 года № 547 Оперативное управление и планирования преобразовано в Главное Управление гражданской обороны Комитета по чрезвычайным ситуациям и гражданской обороны при Правительстве Республики Таджикистан.
Главное Управление гражданской обороны состоит из двух управлений «Организационно-оперативное управление» и «Организационно-мобилизационное управление», которые состоят из соответствующих отделов и секторов.
Деятельность Главного Управления гражданской обороны направлена на организацию и проведение мероприятий гражданской обороны, подготовку и обеспечение оперативной и мобилизационной готовности управлений, отделов Центрального аппарата и структурных подразделений Комитета, разработку и корректировку планов по задачам гражданской обороны, реагирование, предотвращение и ликвидацию последствий чрезвычайных ситуаций, координацию деятельности министерств и ведомств, Управления Комитета в ГБАО, областях, городе Душанбе, сбор, обработку и обмену информаций в области гражданской обороны, защиту населения, объектов экономики и территории Республики Таджикистаном, а также несёт ответственность за организацию мероприятий гражданской обороны и других неотложных работ в случае возникновения чрезвычайных ситуаций в мирное и военное время.